Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis12Q9CY25 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms