Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sgo1Q9CXH7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Sgo1Q9CXH7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Sgo1Q9CXH7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Sgo1Q9CXH7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Sgo1Q9CXH7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Sgo1Q9CXH7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms