Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Utp23Q9CX11 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms