Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ist1Q9CX00 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ist1Q9CX00 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms