Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms