Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pin4Q9CWW6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pin4Q9CWW6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms