Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NubplQ9CWD8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NubplQ9CWD8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms