Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm26657Q9CVR1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm26657Q9CVR1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms