Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms