Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snw1Q9CSN1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snw1Q9CSN1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms