Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029F12RikQ9CRB4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms