Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms