Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
4931417E11RikQ9CR05 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms