Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr3kQ9CQZ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms