Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otub2Q9CQX0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otub2Q9CQX0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms