Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifitm3Q9CQW9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms