Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ykt6Q9CQW1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms