Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Mri1Q9CQT1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mri1Q9CQT1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms