Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms