Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NepnQ9CQ76 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NepnQ9CQ76 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NepnQ9CQ76 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NepnQ9CQ76 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NepnQ9CQ76 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NepnQ9CQ76 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NepnQ9CQ76 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NepnQ9CQ76 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NepnQ9CQ76 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NepnQ9CQ76 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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NepnQ9CQ76 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NepnQ9CQ76 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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NepnQ9CQ76 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NepnQ9CQ76 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms