Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms