Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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