Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nsmce3Q9CPR8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nsmce3Q9CPR8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms