Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms