Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim26Q99PN3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim26Q99PN3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms