Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GpnmbQ99P91 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GpnmbQ99P91 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms