Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcgf6Q99NA9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms