Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a8Q99N10 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ms4a8Q99N10 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Ms4a8Q99N10 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ms4a8Q99N10 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a8Q99N10 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms