Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PccbQ99MN9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PccbQ99MN9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms