Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH5

Nme5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme5Q99MH5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme5Q99MH5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nme5Q99MH5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nme5Q99MH5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nme5Q99MH5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms