Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp1b4Q99ME6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms