Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
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PtprtQ99M80 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
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PtprtQ99M80 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
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PtprtQ99M80 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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PtprtQ99M80 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprtQ99M80 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
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