Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd3Q99LY2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms