Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh3bp5lQ99LH9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp5lQ99LH9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp5lQ99LH9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp5lQ99LH9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms