Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp11Q99K46 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp11Q99K46 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms