Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lims1Q99JW4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lims1Q99JW4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms