Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GatbQ99JT1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GatbQ99JT1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms