Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddb2Q99J79 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ddb2Q99J79 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ddb2Q99J79 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ddb2Q99J79 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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