Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ctu1Q99J10 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms