Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf112Q96DY5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf112Q96DY5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms