Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn16Q925N4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms