Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xrcc4Q924T3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc4Q924T3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms