Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Neurl1Q923S6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1Q923S6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms