Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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Gtpbp3Q923K4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Gtpbp3Q923K4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Gtpbp3Q923K4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtpbp3Q923K4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
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Gtpbp3Q923K4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Gtpbp3Q923K4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Gtpbp3Q923K4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Gtpbp3Q923K4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Gtpbp3Q923K4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Gtpbp3Q923K4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Gtpbp3Q923K4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Gtpbp3Q923K4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Gtpbp3Q923K4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Gtpbp3Q923K4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtpbp3Q923K4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Gtpbp3Q923K4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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