Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim59Q922Y2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms