Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab29Q91YQ1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab29Q91YQ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab29Q91YQ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab29Q91YQ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab29Q91YQ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab29Q91YQ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab29Q91YQ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab29Q91YQ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab29Q91YQ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab29Q91YQ1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab29Q91YQ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab29Q91YQ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms