Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx4Q91YJ2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms