Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd3Q91WC0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Setd3Q91WC0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms