Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csde1Q91W50 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csde1Q91W50 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms