Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Snx9Q91VH2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx9Q91VH2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms